MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p1

Total Repeats: 49774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016594	CGC	2	6	35278	35283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377193
1003	NC_016594	CGG	3	9	35299	35307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377193
1004	NC_016594	GTGC	2	8	35340	35347	0 %	25 %	50 %	25 %	392377193
1005	NC_016594	CCAT	2	8	35427	35434	25 %	25 %	0 %	50 %	392377193
1006	NC_016594	ATGG	2	8	35470	35477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016594	GC	3	6	35562	35567	0 %	0 %	50 %	50 %	392377194
1008	NC_016594	CCT	2	6	35602	35607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392377194
1009	NC_016594	GCG	2	6	35652	35657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377194
1010	NC_016594	GAACCG	2	12	35673	35684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377194
1011	NC_016594	CG	3	6	35810	35815	0 %	0 %	50 %	50 %	392377194
1012	NC_016594	CTT	2	6	35858	35863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_016594	GGC	2	6	35872	35877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_016594	AGC	2	6	35901	35906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377195
1015	NC_016594	GC	3	6	35921	35926	0 %	0 %	50 %	50 %	392377195
1016	NC_016594	CAG	2	6	35957	35962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377195
1017	NC_016594	CGGGC	2	10	35964	35973	0 %	0 %	60 %	40 %	392377195
1018	NC_016594	CGG	2	6	35974	35979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377195
1019	NC_016594	CCG	2	6	35983	35988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377195
1020	NC_016594	GCG	2	6	36068	36073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377195
1021	NC_016594	GTG	2	6	36174	36179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016594	CGC	2	6	36216	36221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_016594	GGC	2	6	36239	36244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377196
1024	NC_016594	CGC	2	6	36253	36258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377196
1025	NC_016594	TCG	3	9	36261	36269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377196
1026	NC_016594	CTT	2	6	36290	36295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392377196
1027	NC_016594	CTC	2	6	36386	36391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392377196
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1029	NC_016594	TCC	2	6	36435	36440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392377196
1030	NC_016594	GGC	2	6	36446	36451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377196
1031	NC_016594	GGC	2	6	36455	36460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377196
1032	NC_016594	GGC	2	6	36485	36490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377196
1033	NC_016594	GGCCTC	2	12	36497	36508	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392377196
1034	NC_016594	GTC	2	6	36524	36529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377196
1035	NC_016594	TCG	3	9	36615	36623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377196
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1038	NC_016594	GACCG	2	10	36791	36800	20 %	0 %	40 %	40 %	392377196
1039	NC_016594	TCA	4	12	36811	36822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392377196
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1041	NC_016594	GCC	2	6	36857	36862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377196
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1043	NC_016594	TCT	2	6	37012	37017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392377196
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1045	NC_016594	TC	3	6	37093	37098	0 %	50 %	0 %	50 %	392377197
1046	NC_016594	GCC	2	6	37110	37115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377197
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1052	NC_016594	GC	3	6	37293	37298	0 %	0 %	50 %	50 %	392377197
1053	NC_016594	CGG	2	6	37301	37306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377197
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1056	NC_016594	GCG	3	9	37351	37359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377197
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1059	NC_016594	GCG	2	6	37387	37392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377197
1060	NC_016594	ACC	2	6	37417	37422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392377197
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1065	NC_016594	ACC	2	6	37612	37617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392377197
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1067	NC_016594	CCA	2	6	37694	37699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392377197
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1069	NC_016594	CGA	2	6	37880	37885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377197
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1072	NC_016594	CGCC	2	8	37943	37950	0 %	0 %	25 %	75 %	392377197
1073	NC_016594	CG	3	6	37990	37995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_016594	A	6	6	38199	38204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016594	GCAGC	2	10	38216	38225	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1076	NC_016594	CCG	2	6	38313	38318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_016594	CGG	2	6	38323	38328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1080	NC_016594	GC	3	6	38366	38371	0 %	0 %	50 %	50 %	392377198
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1083	NC_016594	A	7	7	38473	38479	100 %	0 %	0 %	0 %	392377198
1084	NC_016594	ACC	2	6	38513	38518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392377198
1085	NC_016594	CAC	2	6	38560	38565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392377198
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1088	NC_016594	GGA	2	6	38602	38607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392377198
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1094	NC_016594	GT	3	6	38985	38990	0 %	50 %	50 %	0 %	392377198
1095	NC_016594	GCC	2	6	38998	39003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_016594	TCC	2	6	39005	39010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_016594	CCG	2	6	39011	39016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_016594	AG	3	6	39033	39038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016594	GGA	2	6	39045	39050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016594	TTC	2	6	39062	39067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_016594	CTC	2	6	39123	39128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_016594	CCCA	2	8	39151	39158	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1103	NC_016594	GC	3	6	39173	39178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_016594	GGA	2	6	39208	39213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1107	NC_016594	GGCGA	2	10	39284	39293	20 %	0 %	60 %	20 %	392377199
1108	NC_016594	TCG	2	6	39342	39347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377199
1109	NC_016594	GGCCG	2	10	39350	39359	0 %	0 %	60 %	40 %	392377199
1110	NC_016594	CGC	2	6	39418	39423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377199
1111	NC_016594	TCG	2	6	39447	39452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377199
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1113	NC_016594	GGCTG	2	10	39528	39537	0 %	20 %	60 %	20 %	392377199
1114	NC_016594	CCT	2	6	39587	39592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_016594	CTCC	2	8	39597	39604	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1116	NC_016594	GGGA	2	8	39630	39637	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1129	NC_016594	CAC	3	9	40025	40033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392377200
1130	NC_016594	CGGCC	2	10	40034	40043	0 %	0 %	40 %	60 %	392377200
1131	NC_016594	GTC	2	6	40089	40094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377200
1132	NC_016594	CGG	2	6	40250	40255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377200
1133	NC_016594	GGCCGA	2	12	40256	40267	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392377200
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1135	NC_016594	GGC	2	6	40298	40303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377200
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1139	NC_016594	CGCC	2	8	40403	40410	0 %	0 %	25 %	75 %	392377200
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1142	NC_016594	AAC	2	6	40482	40487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392377200
1143	NC_016594	GGC	2	6	40517	40522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377200
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1145	NC_016594	TGG	2	6	40591	40596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392377200
1146	NC_016594	GCG	3	9	40597	40605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377200
1147	NC_016594	CTG	2	6	40647	40652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377200
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1150	NC_016594	CAC	2	6	40757	40762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392377200
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1152	NC_016594	CCGCC	2	10	40848	40857	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1153	NC_016594	GAC	2	6	40862	40867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1154	NC_016594	CGG	2	6	40872	40877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1155	NC_016594	GAA	2	6	40971	40976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392377201
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1157	NC_016594	GGC	2	6	41127	41132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377201
1158	NC_016594	CGA	2	6	41229	41234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377201
1159	NC_016594	GC	3	6	41245	41250	0 %	0 %	50 %	50 %	392377201
1160	NC_016594	CCG	3	9	41288	41296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392377201
1161	NC_016594	ACG	2	6	41329	41334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377201
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1163	NC_016594	TTA	2	6	41385	41390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1164	NC_016594	CTGC	2	8	41398	41405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1165	NC_016594	GAG	2	6	41410	41415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1166	NC_016594	TCTTT	2	10	41452	41461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1167	NC_016594	TTCTTA	2	12	41512	41523	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1168	NC_016594	TGA	2	6	41534	41539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1169	NC_016594	TCG	2	6	41610	41615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377202
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1182	NC_016594	CAC	2	6	42139	42144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392377203
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1222	NC_016594	TCC	2	6	43837	43842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1223	NC_016594	TCGT	2	8	43845	43852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1224	NC_016594	TGGG	2	8	43891	43898	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1225	NC_016594	CCCT	2	8	43917	43924	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1226	NC_016594	CG	3	6	43997	44002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1227	NC_016594	TTC	2	6	44027	44032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392377204
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1234	NC_016594	CTGG	2	8	44333	44340	0 %	25 %	50 %	25 %	392377204
1235	NC_016594	TGC	3	9	44347	44355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377204
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1239	NC_016594	GGCGG	2	10	44462	44471	0 %	0 %	80 %	20 %	392377204
1240	NC_016594	GGA	2	6	44537	44542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392377204
1241	NC_016594	ACATCG	2	12	44548	44559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392377204
1242	NC_016594	GACG	2	8	44642	44649	25 %	0 %	50 %	25 %	392377204
1243	NC_016594	AAAAG	2	10	44662	44671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1244	NC_016594	CGCGG	2	10	44681	44690	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1245	NC_016594	CTT	2	6	44739	44744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392377205
1246	NC_016594	CGG	2	6	44750	44755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377205
1247	NC_016594	CGA	2	6	44759	44764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392377205
1248	NC_016594	TCG	2	6	44809	44814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377205
1249	NC_016594	TCG	2	6	44872	44877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392377205
1250	NC_016594	CG	3	6	44918	44923	0 %	0 %	50 %	50 %	392377205
1251	NC_016594	GC	3	6	44929	44934	0 %	0 %	50 %	50 %	392377205
1252	NC_016594	GGC	2	6	45024	45029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392377205
1253	NC_016594	CCA	2	6	45111	45116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392377205
1254	NC_016594	TAG	2	6	45127	45132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392377205
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1500	NC_016594	TGT	2	6	53759	53764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392377212

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